Sinds 2 jaar gebruik ik de gratis versie van Avast die op de achtergrond draait, maar als ik een handmatige snelle scan inlas, vindt hij toch nog geïnfecteerde bestanden, hoe kan dat?

Avast draait resident.
Een mogelijkheid kan zijn dat je een geinfecteerd bestand binnen haalt, wat op dat moment door Avast nog niet herkend wordt maar later na een update wel. En dan is er een scan nodig omdat Avast niet continue scant maar alleen bewaakt wat er nu gebeurt zal ik maar zeggen.
Een handmatige scan controleert het hele systeem opnieuw en dan kan er zoiets weer gevonden worden.

Ik doe zelf naast het gebruik van mijn virusscanner gewoon ter zekerheid 1x per maand scannen met Malware Bytes.